Krig, epidemi og El Niño
Set gennem historien sammenfalder El Niño med perioder af tørke nogle steder og andre steder oversvømmelser, der kan medføre epidemier af sygdomme båret af myg, som f.eks. Malaria og Dengue feber. Der er også teorier om en sammenhæng mellem flere væbnede konflikter og El Niño. Risikoen for en væbnet konflikt bryder ud væsentligt større, der hvor de klimatiske forandringer bringer tørke og hungersnød. F.eks. mener man, at en kraftig El Niño kan have været medvirkende til undergangen af flere kulturer i Peru, når klimaforandringer skadede landbruget i regionen.